Akvaariota tulee puhdistaa säännöllisesti viikottaisilla 30-50% vedenvaihdoilla. Oman altaan ekosysteemiin sopivan vedenvaihtokoon löydät vesitestien avulla niitä säännöllisesti seuraamalla. Vedenvaihdon lisäksi akvaarion laseista poistetaan levää, sorapohjasta imetään lapolla sinne kertynyt hajoava bioaines ja suodatin puhdistetaan tarvittaessa.